南京國民政府于1929年頒布的《大學組織法》規(guī)定：大學分為文、理、法、農(nóng)、工、商、醫(yī)等學院，具備上述三所以上的高校，有資格稱大學。私立南通大學紡織科不在規(guī)定范圍內(nèi)，1930年南京國民政府教育部令“先準以南通學院名義立案，俟具備三學院呈部核準后再恢復舊名”。同年11月，私立南通大學遂更名為私立南通學院。